Demi mendukung kinerja SPI IAIN Kediri, disusun struktur organasi sebagai berikut :
Kepala SPI : Dr. Noer Hidayah, M.Si.
Sekretaris SPI : Ahmad Dian Lukman Harun, M.M.
Bidang Pemeriksaan Pengadaan Barang dan Jasa
Ach. Khiarul Waro Wardani
Bidang Pemeriksaan Barang Milik Negara
Andhi Pramono
Bidang Pemeriksaan Kinerja
Ika Insyiroh dan Irma Khoirot Daulay
Bidang Pemeriksaan Laporan Keuangan
Sayekti Indah Kusuma Wardhany
Ketua Bidang Management Resiko
Tim